北交所的核心交易方式是竞价交易，日常买卖主要通过开盘集合竞价、盘中连续竞价和收盘集合竞价完成；在此基础上，市场还设置大宗交易、协议转让等安排，盘后固定价格交易也已纳入新版交易规则框架。对投资者来说，北交所并不是单一的撮合成交模式，而是围绕流动性、股权转让效率和机构交易需求，形成了多层次交易体系。
竞价交易是北交所最常见的交易方式，运行逻辑与沪深市场的集中撮合较为接近，但时间安排和申报规则具有自身特点。每个交易日9:15至9:25为开盘集合竞价，9:30至11:30、13:00至14:57为连续竞价，14:57至15:00进入收盘集合竞价。集合竞价是把一段时间内的买卖申报集中撮合，连续竞价则按照价格优先、时间优先的原则逐笔成交。竞价交易单笔申报通常不得低于100股，卖出时不足100股的零股需要一次性卖出，单笔申报数量最高不超过100万股。
北交所竞价交易还配套30%的价格涨跌幅限制，上市首日等特定情形不设涨跌幅限制。新股上市首日，若盘中成交价较开盘价首次上涨或下跌达到30%、60%，交易所会触发临时停牌，单次停牌10分钟，复牌后通过集合竞价恢复交易。这种制度既给高成长中小企业留下价格发现空间，也通过临时停牌机制降低短时间内剧烈波动带来的交易冲击。连续竞价阶段，限价申报还受到有效价格范围约束，市价申报则采取限价保护，投资者不能简单把市价单理解成无条件追价。
大宗交易主要服务于较大规模的股份转让。按照常见规则，单笔申报数量达到10万股，或者交易金额达到100万元人民币，便可以采用大宗交易方式。它与竞价交易最大的区别，在于买卖双方通常围绕数量、价格和成交安排进行更明确的协商，成交结果也不直接等同于盘中普通订单的连续撮合。对于机构投资者、上市公司股东或需要进行较大规模持股调整的参与者，大宗交易能够减少对二级市场即时价格的冲击，但价格范围、信息披露和股份限售要求仍需严格遵守。
协议转让则更多用于收购、股份权益变动、引进战略投资者等特定事项，并非普通投资者日常买卖股票的主要入口。与此北交所已经引入做市交易机制，部分股票可以在竞价基础上由做市商持续提供双向报价，形成竞价与做市并行的混合交易模式，有助于改善盘口深度、缩小买卖价差。新版北京证券交易所交易规则自2026年7月6日起施行，已明确盘后固定价格交易的制度设计，包括收盘后按时间优先、以当日收盘价撮合；不过相关条款的具体施行时间仍由交易所另行通知，实际操作应以正式落地安排为准。
